Я предлагаю не делать глупости, а объединить оба раздела. Боже, какие допотопные представления… Забудьте вы об этой ерунде. Не так уж геморройно. На одном система с данными, на второй делается system state бэкап. В случае чего, можно быстро восстановится baremetal установкой системы. Даже на сильно отличающееся железо. Я так аж целый сервер из древней KVM виртуалки на живое железо переносил.
А после раззеркаливания система не рухнет? Как это делается, чем? А то как вариант можно было бы вообще уйти от этого сомнительного по необходимости рейда, и сделать 2 раздела из двух отдельных винтов. На одном оставить систему, а второй форматнуть и перенести туда чисто инфу и файлики.